Oparty luźno na autentycznych wydarzeniach film opowiada historię Balto, bezpańskiego psa rasy husky, który w połowie jest wilkiem i jako takiego mieszańca odtrącają go zarówno ludzie, jak i przedstawiciele swojego gatunku. Balto nawiązuje kilka przyjaźni, z gęsią Borisem i dwoma niedźwiedziami polarnymi Mukiem i Lukiem, ale jest szczególnie zwalczany przez przywódcę psiej sfory Steela, z którym rywalizuje o względy pięknej suczki Jenny. Pewnego dnia nawałnica śnieżna odcina od świata wioskę Nome na Alasce, gdzie potrzebne są lekarstwa na zwalczenie epidemii dyfterytu. Kiedy psi zaprzęg, dostarczający antytoksynę grzęźnie w śniegu, Balto staje się jedyną deską ratunku dla mieszkańców wioski.